REVIEW JURNAL BIOINFORMATIKA

Judul      : Analisis Bioinformatika Berbasis WEB untuk Eksplorasi Enzim Kitosanase Berdasarkan                     Kemiripan Sekuens
Jurnal     : Jurnal Al-Azhar Indonesia Seri Sains dan Teknologi
Link       : jurnal.uai.ac.id/index.php/SST/article/download/84/80
Tahun     : 2012
Penulis   : Vanny Narita,  Arif Lelono Arum, Siti Isnaeni M dan Nuri Y.    Fawzya
Reviewer: Aldi Iman Fahroezi
Tanggal   : 20 Oktober 2017

Abstrak

Jurnal yang berjudul "Analisis Bioinformatika Berbasis WEB untuk Eksplorasi Enzim Kitosanase Berdasarkan Kemiripan Sekuens" ini berisi tentang kehadiran bioinformatika berbasis WEB yang memiliki tujuan untuk melakukan serangkaian analisis sekuen, baik itu DNA maupun protein, yang dapat digunakan sebagai penelitian pendahuluan,  sehingga ekplorasi enzim menjadi lebih tepat sasaran. Analisis yang dilakukan yaitu dengan mencari tahu ketersediaan sekuen yang telah ada di Gene Bank yang merupakan strain baru khas dari indonesia yang belum terpublikasikan.

Abstrak yang disajikan penulis menggunakan dua Bahasa yaitu Bahasa inggris (Bahasa Internasional) dan Bahasa Indonesia, sehingga pembaca dapat membaca dengan bahasa indonesia atau bahasa inggris. Secara keseluruhan isi dari abstrak ini langsung menuju ke topic bahasan yang dibahas dalam jurnal ini, yang menurut saya pembaca menjadi mudah dalam memahami jurnal tersebut.

Pendahuluan

Di dalam paragraf pertama, penulis menjelaskan bahwa pencarian mikroba dengan menggunakan metode sederhana sudah tidak lagi efisien dan hanya menghabiskan biaya dan tenaga saja. Saya setuju dengan pendapatnya penulis, Oleh karena itu diperlukan sebuah teknologi baru untuk menunjang efektivitas dan efisiensi sehingga hadirlah Bioinformatik sebagai pencarian sekuen enzim baru dengan sebuah analisis filogeni (kekerabatan).

"Bioinformatika" adalah konsep yang diberikan penulis, sedangkan implementasinya yaitu dijabarkan dalam bentuk tujuan dan metode penelitian yang berkaitan dengan bioinformatika. Paragraf kedua saya sangat mendukung sekali metode yang digunakan penulis karena dengan metode bioinformatik tersebut terdapat sebuah keunggulan yaitu selain akan hemat biaya dan tenaga juga dapat menjadi penelitian pendahuluan sebelum percobaan nyata dilakukan.

Hasil dan Pembahasan

Pada hasil dan pembahasan ini penulis membahas tentang hasil bakteri yang diperoleh ternyata tidak menunjukkan kemiripan identik dengan sampel. Sehingga sampel tersebut berpeluang menjadi strain baru asli dari indonesia yang terpublikasi oleh umum. Terdapat beberapa perbedaan hasil genus atau tingkat spesies namun hal ini bisa depecahkan dengan CLUSTALW2 untuk dibuat filogeninya yang diperlukan dalam pembacaan sekuen mana yang paling dekat dengan sampel.

Terdapat lima mikroba yang terdapat dalam Gene Bank yang mana kelima mikroba tersebut tidak memiliki gen penyandi kitosanase, namun memiliki gen kitinase. Tidak adanya gen kitonase ini mengidentifikasikan bahwa kelima mikroba ini adalah bakteri baru yang belum terpublikasi.

Penulis juga menyebutkan jika bakteri Acinobacter baumanni banyak ditemukan di rumah sakit dan pasien yang dirawat, yang mana bakteri ini bersifat patogen yang dapat menginfeksi luka, sistem pernafasan dan urin. Saya berharap bakteri jenis ini dapat diminimalisir atau bisa dicegah agar tidak dapat menginfeksi ke manusia sehingga tidak menimbulkan penyakit atau kerugian bagi manusia.

Simpulan

Pada bagian kesimpulan, penulis menyimpulkan bahwa kelima mikroba yang diidentifikasi merupakan bakteri baru yang belum tersekuen gen kinotasenya dan menyatakan jika hal tersebut memberikan peluang untuk eksplorasi dan publikasi Gene Bank serta akan menambah kepustakaan gen dunia.

Kekuatan Penulis

Teori dan metode penelitian yang digunakan sudah tepat.

Penulis menyimpulkan hasil penelitian dengan singkat dan jelas.

Kelemahan Penulis 

Bahasa yang digunakan oleh penulis sedikit sulit dipahami oleh orang umum karena banyak menggunakan bahasa ilmiah.